“靶”蛋白翻译后修饰 (PTMs) — 质谱分析

“靶”蛋白翻译后修饰 (PTMs) — 质谱分析

简介：

• 在不同的生理和病理状态下，蛋白质翻译后修饰（Protein Post-translational Modifications, PTMs）通常呈现不同的状态，从而发挥多样的调控功能。PTMs种类和功能多样，通常一个蛋白质分子上可同时存在多种不同的PTMs。

• 质谱是目前常用的、进行PTMs筛选的高通量技术。常规的实验流程是用特定的PTMs抗体（比如乙酰化抗体、甲基化抗体等）或化学材料（如TiO2实现对磷酸化肽段富集）通过免疫沉淀（IP，Immunoprecipitation）/pull-down富集有特定PTMs修饰的肽段/蛋白质后，再进行质谱检测和分析，从“泛”的层面，筛选（1）发生特定PTM修饰的蛋白质（蛋白质种类鉴定），（2）特定PTMs修饰在蛋白质的那些氨基酸上（位点鉴定）。然而，该技术流程有其缺陷，体现在（1）商业化的、高亲和力的PTMs抗体种类有限，不是所有的PTMs类型都有相应的抗体。（2）数据的假阳性问题。

• 另一种策略是聚焦研究的靶蛋白（Bait Protein），利用免疫沉淀（IP）高效富集靶蛋白后结合质谱检测和分析，解析靶蛋白上可能存在的PTMs，从而为深入解析靶蛋白PTMs对生理/病理的调控机理。

• 谱璟科技基于其在IP-MS和SILAC-IP-MS上的技术积累，可实现对靶蛋白上潜在PTMs类型和修饰状态的深入解析。

技术流程：

实验数据：